Nobel-díj az élet kémiájáért
címmel írt a BBC News a díjátadást követő napon a kémiai Nobel-díjról.
A „riboszóma szerkezetének és működésének kutatásáért” Venkatraman
Ramakrishnannak, Thomas A. Steitznek, és Ada E. Jonatnak (Yonath)
ítélték a 2009-es kémiai Nobel-díjat. A riboszóma hatalmas
molekularendszerének (kb. 2,5 megadalton molekulasúllyal), valóban
kulcsszerepe van: ez a sejtek „fehérjegyára”. A riboszóma fordítja le
a DNS által hordozott genetikai információt a transzfer-RNS
közvetítésével, majd ennek az információnak a birtokában szintetizálja
a fehérjéket. Az ezévi díj ismertetését a kémiai Nobel-díj bizottság
Charles Darwin 1869-ben publikált fejlődéselméletének említésével
kezdi, utalva arra, hogy ez a díj a harmadik azon díjak sorában,
amelyek bizonyítják, hogy Darwin elképzelései helyesek voltak. Az első
Francis Crick, James Watson és Maurice Wilkins 1962-es Nobel-díja
volt, a DNS szerkezetének meghatározásáért. A második Roger Kornberg
díja 2006-ban, annak eldöntéséért, hogyan másolódik az információ a
hírvivő (messenger) RNS-molekulákra. Végül, a mostani Nobel-díj azt
fedi fel, hogyan történik az a lépés, amelyben a genetikai információ
a DNS-ből eljut a fehérjékhez; ahogy a Nobel-bizottság írja: „hogyan
jelenik meg bennünk, nemcsak mint hallás, érzékelés és ízlelés, vagy
izmok, csontok és bőr, hanem mint gondolatok és beszéd is.”

Ada Jonat Budapesten, 2004-ben
(Hargittai Magdolna felvétele)
Ada Jonattal évekkel ezelőtt
ismerkedtem meg, és felvettem vele egy beszélgetést, amely a Candid
Science című könyvsorozatunkban jelent meg (Hargittai I. – Hargittai
M., 2006). Célratörő, hatalmas energiával rendelkező egyéniség;
enélkül nem járhatta volna be azt az utat, amelyet megtett.
Jeruzsálemben született 1939-ben, szülei Lengyelországból emigráltak
az akkori Palesztinába. Tizenegy éves volt, amikor édesapja meghalt,
és Ada ettől kezdve állandóan dolgozott a tanulás mellett, fiatalabb
gyerekeket korrepetált, kishúgáról gondoskodott. Így emlékezett vissza
erre az időre: „Soha nem volt időm semmire, mert iskola előtt és
iskola után mindig volt valami tennivalóm.” Másik gyermekkori emléke
az, hogy mindig többet akart tudni; soha nem volt neki elég, amit az
iskolában tanult, amikor csak lehetett, az iskolai könyvtárban
hozzáolvasott a tanult anyaghoz. Gimnázium után a jeruzsálemi Héber
Egyetem kémia szakára jelentkezett, és felvették, annak ellenére,
hogy igen nehéz volt bejutni. A biokémia és biofizika érdekelte
elsősorban, MSc-fokozatot biofizikából szerzett. Doktori munkája a
Weizmann Intézetben a kollagén szerkezetvizsgálata volt. Kétéves
amerikai posztdoktori munka után beindította saját
fehérjekrisztallográfia csoportját; elsőként Izraelben. Évekig
tartott, amíg a csoportnak publikálható eredményei lettek.
Az 1970-es évek elején találkozott
először a riboszómával, amikor együttműködést alakított ki az
intézetükben Michel Ravellel. Rajta keresztül ismerkedett meg Paul
Siglerrel, aki akkor a Chicagói Egyetemen (később a Yale-en) a
szerkezeti biológia egyik úttörője volt. Sigler laboratóriumában
töltött egy évet, és ott próbált először kristályt növeszteni a
riboszómából, sikertelenül. Berlinben, a Max Planck Intézetben,
Heinz-Günter Wittmann is a riboszómával foglalkozott, és meghívta,
hogy dolgozzon velük. Jonat, látván, hogy a berlini intézetnek milyen
nagy mennyiségű aktív és tiszta riboszómája volt, javasolta, hogy
próbálják meg a kikristályosítást. Szerencséjére a berlini kollégák
támogatták ezt a próbálkozást, mégha nem is kecsegtetett sikerrel.
Sokan reménytelennek tartották ezt a vállalkozást – és okkal. A
riboszóma óriási és bonyolult RNS-fehérjekomplex. Két részből áll, az
ún. nagy alegységből és a kis alegységből. Egy emberi riboszóma nagy
alegységében három RNS-molekula és körülbelül ötven fehérjemolekula
van, míg a kis alegységben egy RNS- és harmincöt körüli
fehérjemolekula. Ez azt jelenti, hogy összességében több ezer
nukleotid és ugyancsak több ezer aminosav van bennük, vagyis, sok
százezer atom; ezek helyzetét akarták meghatározni. Nem lehet
csodálkozni azon, hogy a legtöbben szkeptikusak voltak vállalkozását
illetően, de Jonatot ez nem zavarta. Ahogy mondta: „Arra gondoltam, ha
nem sikerül, legfeljebb olyan hírességek előkelő csoportjához fogok
csatlakozni, mint Francis Crick, James Watson, Aaron Klug, Alex Rich
és mások. Tudtam, hogy számomra ez a nagy lehetőség. Nagyon gondosan
kezdtem hozzá, figyelembe véve, hogy a kristályosítás nehézségeit
egyrészt a riboszóma heterogén jellege okozza, másrészt pedig az, hogy
könnyen elbomlik. Mindent elolvastam a riboszóma irodalmából, amit
csak találtam, a legrégebbi munkákig. Különösen érdekeltek azok a
módszerek, amelyeket a riboszóma tartósítására fejlesztettek ki; ez
alapvető a kristályosításhoz. Néhány hónap múlva már voltak
mikrokristályaink – de aztán legalább négy évbe telt, amíg sikerült az
első használható diffrakciós felvételeket elkészíteni. Első cikkünk az
1980-as évek elején jelent meg, és azóta egyfolytában a riboszómával
foglalkozunk.”
A hosszú évek során Jonat és
munkatársai mindent megpróbáltak, hogy stabilizálni tudják a
riboszómát ahhoz, hogy jó minőségű felvételt tudjanak róla készíteni.
Baktérium-riboszómákat vizsgáltak, és olyan baktériumokat
választottak, amelyek nehéz körülmények között is léteznek, és ezért
feltehetően riboszómájuk is ellenállóbb, mint másoké. Ezért
hőforrásokból és a Holt-tenger erősen sós vizéből gyűjtöttek mintákat.
Végül, az 1990-es évek elejére sikerült jó minőségű |
|
felvételeket készíteni, és ezzel
azt sugallták, hogy mégsem lehetetlen, hogy meghatározhassák a
riboszóma szerkezetét. Pedig ekkor még komoly akadályok álltak
előttük. Így például, hiába voltak a kristályok már hibátlanok és a
diffrakciós felvételek elég jók, az ún. fázisprobléma miatt nem tudták
azokat értelmezni. Közben, Jonaték eredményei nyomán, egyre több
kutatócsoport kezdett a témával foglalkozni. A fázisproblémát a Yale
Egyetemen Thomas Steitz és csoportja oldotta meg, és ők publikálták az
első kristályszerkezetet 1998-ban, ami azonban még nem volt elég nagy
felbontású ahhoz, hogy az atomi helyzeteket meghatározhassák. Óriási
verseny kezdődött – vagy inkább folytatódott – a vezető
kutatócsoportok között. Végül, a három díjazott nagyjából egy időben,
2000 őszén publikált olyan szerkezeteket, amelyek már az atomi
helyzeteket is megadták. Steitz és csoportja a nagy alegység, míg
Jonat és Venkatraman Ramakrishnan a kis alegység szerkezetét
határozta meg nagy felbontásban. A továbbiakban fokozatosan
értelmezték, hogyan is történik, lépésről lépésre, a fehérjeszintézis
a riboszómában. Megállapították, hogy a peptidek és ezekből a fehérjék
képződése a nagy alegységben történik, mégpedig hihetetlenül gyorsan.
Venkatraman Ramakrishnan fedezte fel a kis alegység szerepét.
Megállapította, hogy ez az alegység „fordítja le” a DNS és RNS által
hordozott információt a fehérjék nyelvére.
Riboszóma minden élő szervezetben
van, de a különböző fejlettségű szervezetekben különbözőek, és éppen
ez teszi ismeretüket felbecsülhetetlenné új antibiotikumok
kifejlesztésében. Az antibiotikumok a riboszóma különböző részeihez
kapcsolódhatnak, és így azok működését, vagyis fehérjetermelését
megakadályozhatják; és így a baktérium elhal. Ugyanakkor ezek az
antibiotikumok az emberre nem hatnak, ezért használatuknak nincs
mellékhatása. Egyes, így tervezett antibiotikumok már a klinikai
kipróbálás stádiumában vannak. Ma már azt is tudják, hogy az eddig
alkalmazott antibiotikumok egy része is a riboszóma működésének
akadályozásával fejti ki hatását.
A riboszóma a legnagyobb
aszimmetrikus rendszer, amelynek a szerkezetét valaha meghatá-rozták.
Azonban, évekkel ezelőtt, Jonat és munkatársai a nagy alegységben
kétfogású forgási szimmetriát figyeltek meg, éppen a működés
szempontjából döntő molekularészben. Az évek során kiderült, hogy ez a
szimmetria minden eddig meghatározott riboszóma szerkezetére jellemző.
A felismerés Jonatékat is meglepte, de idővel rájöttek arra, hogy
ennek a riboszóma működése szempont-jából van jelentősége. Megint Jonat
szavaival:
„Ez a szimmetria a nagy alegység
aktív centruma körüli területen jelentkezik, azon helyek között, ahol
a transzfer RNS-ek az aminosavakkal belépnek, és ahol a felépülő
aminosavlánc kilép. Eredetileg nem értettük, miért alakult ki ez a
szimmetria, de aztán rájöttünk, hogy a peptidkötés sztereokémiája
igényli ezt. Az amonosavakkal bejövő transzfer RNS-nek és az épülő és
kifelé haladó fehérjének igazodniuk kell egymáshoz, és ezt biztosítja
ez a dinamikus forgási szimmetria. Amikor a szimmetria dinamikus
voltáról beszélek, akkor az egész katalitikus esemény dinamikájára
utalok. Több mint egy évbe tellett, amíg meg tudtuk győzni önmagunkat,
hogy ez a szimmetria valóban létezik. Ez, persze, még gyönyörűbbé
teszi a szerkezetet. Eredetileg nem volt nagy sikerünk ezzel a
megfigyeléssel. A Yale-csoportnak más elképzelése volt a kémiai
katalízis lefolyásáról, és sokat vitáztunk erről. Végül mindenki
elfogadta az általunk javasolt mechanizmust, amely feltételezi a
szerkezetben az aktív rész körüli dinamikus kétfogású forgási
szimmetriát. Az is kiderült, mi volt az oka a véleménykülönbségnek. A
mi vizsgálataink fiziológiai körülmények között folytak, míg a
Yale-csoport olyan körülmények között dolgozott, amelyek távol voltak
a fiziológiai feltételektől, és ezért volt a rendszerükben jelentős
rendezetlenség a müködés szempontjából fontos helyzetekben.”
Ada Jonattal 2004-ben beszélgettem.
Természetesen megkérdeztem tőle, hogy milyen esélyt lát a Nobel-díjra?
A következőt válaszolta: „Kihagyhatnánk ezt a kérdést? Nagyon zavarba
hoz. Amikor sikerült az első mikrokristályt előállítanom, találkoztam
egy svéd professzorral, aki a szerkezeti biológia egyik alapító atyja
volt. Abban az időben nagyon keményen dolgoztam, alig aludtam valamit.
Látta rajtam, hogy sápadt és nyúzott vagyok, ezért megkérdezte, mi van
velem. Mondtam, hogy lehet, hogy van riboszóma-kristályom. Rámnézett,
és azt mondta: ez Nobel-díjas projekt… Mindez még a munka
legelején történt. Soha nem beszéltem erről, de nem is feledkeztem meg
róla; azóta állandóan velem van ez a gondolat. Amikor az első
nagyfelbontású eredményeinket megkaptuk, a Nobel-díj kérdése ismét
előjött. Tudom, hogy ez a kutatás már évek óta a figyelem
középpontjában van, tehát nem lennék őszinte, ha nem vallanám be, hogy
igen, tudom, hogy elvileg ez elképzelhető.” A díj kihirdetése után az
egyik hírügynökségnek a következőt mondta Jonat: „Amikor szólt a
telefonom, és megláttam a 46-os számot, Svédország országkódját, arra
gondoltam, most már tényleg túlzásba viszik a viccelődést. De a hívó
akcentusa nagyon svéd volt, komolyan hangzott, úgyhogy el kellett,
hogy higgyem, ez valódi hír!”
Jonattól azt is megkérdeztem, hogy
volt-e a munkájában valaha is hátránya abból, hogy nő. Ezt válaszolta:
„Nem. Talán csak annyi, hogy időnként azt éreztem, többet várnak
tőlem, mint amennyit egy férfitől várnának ugyanebben a pozícióban. A
pályám elején, mivel tapasztalatlan voltam a krisztallográfiában,
nagyon lassan haladtam, de ennek semmi köze nem volt ahhoz, hogy nő
vagyok. Abban az időben egyszer nem kaptam meg a várt előléptetést a
Weizmann Intézettől, és az egyik professzor megjegyezte, hogy nem
félnek attól, hogy elmegyek, mivel a férjem is ott dolgozik. Ezt,
persze, nem értékeltem.”
Élete legnagyobb kihívásairól a
következőket mondta: „Tudományosan a riboszóma kristályosítása óriási
kihívás volt, személyesen pedig az az időszak, amikor édesapám
meghalt. Néhány évvel ezelőtt előadást kellett tartanom az unokám
óvodájában a riboszómáról. Az hihetetlenül nehéz volt.”
Kulcsszavak: kémiai Nobel-díj, Ada Jonat, riboszóma szerkezete,
fehérjeszintézis, női tudósok
IRODALOM
Hargittai, Magdolna
(2006): Ada Yonath. In: Hargittai István – Hargittai Magdolna: Candid
Science VI: More Conversations with Famous Scientists. Imperial
College Press, London, 389–401. |
|